中醫醫史文獻教研室是由原基礎醫學院中醫文獻教研室和中國醫學史教研室合并而成的，是中醫醫史文獻學科的主體。中醫醫史文獻學科是從史學、文獻學的角度研究中醫藥學的理論與經驗、學術特征與發展規律的一門學科。本學科由著名中醫學家任應秋教授于上世紀50年代創建，1981年、1996年分別被首批批準為博士學位授權點和中醫學博士后流動站，2002年被批準為北京市重點學科，2007年我校中醫學一級學科被批準為國家重點學科，本學科作為中醫學的二級學科進入了國家重點學科的行列?，F為中華中醫藥學會醫史文獻分會副主任委員單位。
本教研室承擔著全校各專業、各層次研究生、本科生、留學生以及成人教育學員的《中國醫學史》《中外醫學史》《中醫文獻學》《中醫藥信息檢索》《中醫漢語Ⅰ》《中醫漢語Ⅱ》6門課程的教學任務。目前共有專任教師10人，其中教授2人，副教授3人，講師5人。具有碩士學位3人，博士學位4人，博士后3人。
學科帶頭人：嚴季瀾
教研室主任：李柳驥
支部書記：孫靈芝
教師：周立群 許亦群 甄雪燕 紀征瀚 陳昱良 馬明越 孫鑫